นิเวศวิทยาชุมชน ศึกษาเกี่ยวกับองค์กรและการทำงานของชุมชนซึ่งเป็นกลุ่มของประชากรที่มีปฏิสัมพันธ์ของสิ่งมีชีวิตที่อาศัยอยู่ในพื้นที่หรือถิ่นที่อยู่เฉพาะเมื่อประชากรของสปีชีส์มีปฏิสัมพันธ์ซึ่งกันและกัน พวกมันจึงก่อตัวเป็นชุมชนทางชีววิทยา จำนวนของสายพันธุ์ที่มีปฏิสัมพันธ์ในชุมชนเหล่านี้และความซับซ้อนของความสัมพันธ์ของพวกมันเป็นตัวอย่างของความหมายของคำว่า "ความหลากหลายทางชีวภาพ" โครงสร้างเกิดขึ้นภายในชุมชนเมื่อสปีชีส์มีปฏิสัมพันธ์กัน และห่วงโซ่อาหาร สายใยอาหาร กิลด์ และสายใยเชิงโต้ตอบอื่นๆ ก็ถูกสร้างขึ้น ชุมชน ความสัมพันธ์เหล่านี้เปลี่ยนแปลงตามเวลาวิวัฒนาการเนื่องจากสปีชีส์ปรับตัวเข้าหากันผ่านกระบวนการวิวัฒนาการร่วมกัน โครงสร้างโดยรวมของชุมชนทางชีววิทยา การจัดระเบียบของปฏิสัมพันธ์ระหว่างความเฉพาะเจาะจง และผลกระทบที่กระบวนการวิวัฒนาการร่วมกันมีต่อชุมชนทางชีววิทยาได้อธิบายไว้ด้านล่าง